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Rétrotranscription chez HIV
La RT est une enzyme multifonctionnelle qui possède à la fois une activité ADN polymérase ADN et ARN dépendante ainsi qu’une activité RNase H qui dégrade sélectivement le brin ARN dans un hybride ADN/ARN. Toutes ces activités sont nécessaires à la rétrotranscription, au cours de laquelle l’ARN génomique simple brin est converti en ADN proviral double brin.
1 : Initiation de la synthèse du brin d'ADN (-). Amorce = ARNt (ARNt3-Lysine) .
2 : Synthèse de l'ADN appelé "Strong-Stop" (-) et dégradation par l'activité RNase H de l'ARN matrice .
3 : Etape dite de "Saut du brin d'ADN "Strong-Stop" (-)" . A ma connaissance, la plupart des auteurs penchent pour un "saut" sur le 2° génome du virus (n'oublions pas que le virus est "diploïde"). Bien voir l'hybridation sur la "séquence R".
4 : Fin de la synthèse du brin d'ADN (-) et dégradation par l'activité RNase H de la matrice ARN .
5 : Initiation de la synthèse du brin d'ADN (+) au niveau de la séquence résistante à l'activité RNAse H à proximité de U3 et sa synthèse (donne une zone dite aussi ADN "strong-stop").
6 : Initiation de la synthèse du brin d'ADN (+)au niveau la 2° séquence résistante à l'activité RNAse H ;
7 : Dégradation des 2 amorces ARN et coupure spécifique au niveau de l'ARNt amorce
de départ (activité RNase sur hybride RNA/DNA).
8 : Saut de brin de l'ADN "Strong-Stop" (+).
9 : Terminaison de la synthèse du brin ADN(-).
10 : Terminaison de la synthèse du brin ADN(+). Arrêt de synthèse à un site spécifique riche en AT déterminant le départ de la RT. Il y a une coupure simple brin et des bases en "recouvrement" !