La thiamine diphosphate (on dit aussi pyrophosphate) est un cofacteur organique d'enzyme de type groupement prosthétique. Le motif thiamine a le statut de vitamine. La carence en thiamine entraîne le béri-béri (marqué par un affaiblissement généralisé, des douleurs, des problèmes nerveux périphériques, un rythme cardiaque perturbé ...). Historiquement, c'est la découverte , en Asie, des propriétés anti béri-béri d'un régime alimentaire utilisant du riz complet à l'encontre d'un régime au riz blanc (l'enveloppe du grain de riz est riche en thiamine, le riz blanc - grain de riz sans son enveloppe - est pauvre en thiamine) qui aboutit peu à peu à la découverte et à l'élucidation de la thiamine. Les travaux au sujet du béri-béri, au début du 20° siècle, sont ainsi à l'origine du concept de vitamine (vitamine est un mot valise signifiant "amine nécessaire à la vie" et formé parce que la thiamine est aminée). La thiamine fut la première vitamine isolée.
La thiamine diphosphate catalyse, au sein du site actif, la formation ou le clivage de liaisons C-S, C-N, C-O ou C-C. La page du site EMBL-EBI "CoFactor - The organic enzyme cofactor database" donne la mécanique de cette chimie. http://www.ebi.ac.uk/thornton-srv/databases/CoFactor/mechanism.php?cid=1&pidArray=Array&oneDigitRefs=Array
Un complexe enzymatique très célèbre utilisant la thiamine diphosphate est le complexe pyruvate déshydrogénase. La première enzyme du complexe catalyse la décarboxylation du pyruvate grâce au groupement prosthétique thiamine diphosphate.
Notes. Les sites Wikipedia en anglais (consultation 27/11/2014) concernant le béri-béri et la thiamine sont bien faits : http://en.wikipedia.org/wiki/Beriberi et http://en.wikipedia.org/wiki/Thiamine. On regrettera l'absence du Japonais Umetaro Suzuki dans l'historique, mais il a "droit" à une page à http://en.wikipedia.org/wiki/Umetaro_Suzuki