2. Structure des virus HIV de l'immunodéficience humaine

Sommaire de la page "Structure des virus HIV de l'immunodéficience humaine" et liens vers les paragraphes cités.

2.1 - Morphologie | 2.2 - Analyse du génome des Rétrovirus HIV

2.1 - Morphologie

On rencontre en fait 2 types de virus HIV, HIV-1 et HIV-2, mais de morphologie et de structure sensiblement identiques.

Les particules virales mûres sont grossièrement sphériques. La capside a une forme en tronc de cône.

Schéma repris depuis http://membres.lycos.fr/neb5000/VirologieI (2004) et retravaillé (cours de Virologie, Université Paris VI, notes déposées sur internet par un étudiant)

On distingue :

• une enveloppe : dans laquelle sont incluses des spicules formées par l'association de deux glycoprotéines virales (fonction de reconnaissance du récepteur et fonction de fusion enveloppe/membrane cellule hôte).
La protéine MA (MA comme matrice) tapisse la face interne de l'enveloppe et constitue la matrice.

• une capside : formée par l'assemblage d'une protéine virale appelée gag.

La capside contient le génome viral et les protéines liées de nucléocapside ainsi que les enzymes RT , INT et protéase.
On trouve dans chaque virion une cinquantaine de molécules de chaque enzyme.

• le génome est diploïde : 2 ARN monocaténaires identiques d'environ 10 KB. En 5' un ARN-t cellulaire (c'est à dire en provenance d'une cellule infectée qui a conduit aux virions !) est hybridé à chaque ARN viral. Les deux ARN sont étroitement associés à des protéines NC (pour nucléocapside), qui les réunissent, les protègent de l'activité des enzymes cellulaires et interviennent dans l'assemblage des virions.

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2.2 - Analyse du génome des Rétrovirus HIV (dans les virions)

Le génome code les protéines virales et il est encadré par 2 régions non codantes. De 5' en 3' on trouve :

la région non codante 5'. R (séquence répétée, Repeat), U5 (Unique 5'), PBS (Primer Binding Site) ;
Le gène gag (pour group specific antigens) code une polyprotéine qui sera découpée en protéines (de capside, de nucléocapside et de matrice) par la protéase virale ;
le gène pol (pour polymérase) qui code in fine les trois enzymes virales : la rétrotranscriptase, l'intégrase et la protéase ;
le gène env (pour enveloppe) code une protéine précurseur membranaire (la gp160) qui sera glycosylée puis clivée en TM gp41 et SU gp120 qui, restant associées, vont constituer les spicules ;
de part et d'autre du gène env on trouve, chez les Lentivirus, des gènes de régulation;
la région non codante 3'. R (séquence répétée, Repeat), U5 (Unique 5').

Il est important de savoir que les régions non codantes sont des régions stratégiques du virus. On y trouve des signaux de régulation de la transcription (en ARN) et de la traduction (en protéines), des séquences d'amorçage de la réplication, des signaux pour l'intégration et pour l'encapsidation.

Ainsi, on peut signaler (de façon très incomplète):

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